Γεννήθηκε το 1570 σε μία πάμφτωχη οικογένεια με μητέρα πλύστρα, σύμφωνα όμως με τους ιστορικούς, η προγονική καταγωγή του ήταν βυζαντινή και κράταγε από την τελευταία δυναστεία των Παλαιολόγων. Μετά την άλωση της Πόλης το 1453, οι πρόγονοί του έφυγαν πρόσφυγες από την Κωνσταντινούπολη και μετά από ένα περιπετειώδες οδοιπορικό στα βόρεια Βαλκάνια, κατέληξαν στην Κρήτη, που τα χρόνια εκείνα ονομαζόταν «μικρή Ελλάς», ενώ βρισκόταν υπό ενετική κατοχή.
27 Ιουνίου 1638: Κωνσταντίνος (Κύριλλος) Λούκαρις, από τον Χάνδακα (Ηράκλειο) στη Κωνσταντινούπολη
